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visual3d:tutorials:modeling:plug-in_gait_full-body

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visual3d:tutorials:modeling:plug-in_gait_full-body [2024/11/15 15:28] – [Head Segment] wikisysopvisual3d:tutorials:modeling:plug-in_gait_full-body [2025/09/22 17:56] (current) – [Background] wikisysop
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 ====== Plug-In Gait Full-Body ====== ====== Plug-In Gait Full-Body ======
- 
-===== Introduction ===== 
  
 This tutorial describes how to implement the Golem/Plug-in Gait Upper Extremity model as implemented in Vicon (via Bodybuilder/PIG) in Visual3D. The Golem or Plug-in-Gait upper body model consists 9 segments: This tutorial describes how to implement the Golem/Plug-in Gait Upper Extremity model as implemented in Vicon (via Bodybuilder/PIG) in Visual3D. The Golem or Plug-in-Gait upper body model consists 9 segments:
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   * Left/Right Hands   * Left/Right Hands
  
-The Pelvis definition is not described in this tutorial, but can be found in the [[Visual3D:Tutorials:Modeling:Plug-In_Gait_Lower_Limb|Lower Body Tutorial]].+The Pelvis definition is not described in this tutorial, but can be found in the [[visual3d:tutorials:modeling:plug-in_gait_lower_limb#pelvis_segment|Lower Body Tutorial]]. The Clavicle segment's definitions are described in the Vicon documentation but are not used for kinetics/kinematics. They can only be tracked when using [[Visual3D:Documentation:Kinematics_and_Kinetics:Inverse_Kinematics|Inverse Kinematics]] and are therefore omitted from this model. Details about implementing this segment are provided in the [[visual3d:tutorials:modeling:plug-in_gait_full-body#clavicle|Clavicle]] section of this tutorial.
  
-Definition of the Clavicle segments are also described in the Vicon documentation - but they are not used for kinetics/kinematics, and can only be tracked when using [[Visual3D:Documentation:Kinematics_and_Kinetics:Inverse_Kinematics|Inverse Kinematics]]. For this reason, these segments are not included in this model, but there is more information about this in the Clavicle section of this tutorial.+The Plug-In Gait Full-Body model consists of the Plug-In Gait Upper Extremity model alongside the Plug-In Gait Lower Limb model. Complete the [[Visual3D:Tutorials:Modeling:Plug-In_Gait_Lower_Limb|Lower Body Tutorial]] to create the lower extremity segments and produce the entire Full-Body model.
  
-To create the pelvis and all other lower extremity segments, please view the [[Visual3D:Tutorials:Modeling:Plug-In_Gait_Lower_Limb|Lower Body Tutorial]]. 
- 
-===== Background ===== 
- 
-The information for this tutorial was obtained from: 
- 
-  * Plug-In Gait Manual (version 1) <sup>[[#cite_note-PiGManual-1|[1]]]</sup> 
-  * Plug-in Gait Marker Set <sup>[[#cite_note-PiGMarker-2|[2]]]</sup> 
  
 ==== Documentation Differences ==== ==== Documentation Differences ====
  
-The tutorial tries to follow Vicon's instructions as close as possible, but some modifications were required to implement the model in Visual3D. This means that results from Vicon and Visual3D may show some small differences. Some of the bigger differences are described below. +The tutorial tries to follow Vicon's instructions as close as possible, but some modifications were required to implement the model in Visual3D. This means that results from Vicon and Visual3D may show some small differences. Some of the bigger differences are described below. At this time, no comparisons have been made between this model and the one provided by Vicon. The tutorial was not meant to be comprehensive and variations may exist between this version of the Golem model and the Vicon Golem model.
- +
-At this time, no comparisons have been made between this model and the one provided by Vicon. The tutorial was not meant to be comprehensive and variations may exist between this version of the Golem model and the Vicon Golem model.+
  
 === Segment Origin === === Segment Origin ===
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 === Segment Orientation === === Segment Orientation ===
  
-This tutorial uses the Visual3D default segment orientation. The default segment orientation for Visual3D is:\\ +This tutorial uses the Visual3D default segment orientation. The default segment orientation for Visual3D is: 
- +  * X - ML (red) 
- +  * Y - AP (green) 
-  * X - ML (red)\\ +  * Z - Axial (bue)
- +
-  * Y - AP (green)\\ +
- +
-  * Z - Axial (bue)\\ +
- +
- +
-If you review the Vicon documenation<sup>[[#cite_note-PiGManual-1|[1]]]</sup>, the segment orientation and colors are different from those in Visual3D. Vicon's coordinate systems are:\\ +
- +
- +
-  * Y - ML (blue)\\ +
- +
-  * X - AP (green)\\ +
- +
-  * Z - Axial (red)\\+
  
 +If you review the Vicon documenation<sup>[[#cite_note-PiGManual-1|[1]]]</sup>, the segment orientation and colors are different from those in Visual3D. Vicon's coordinate systems are:
 +  * Y - ML (blue)
 +  * X - AP (green)
 +  * Z - Axial (red)
  
 This means if you use the Visual3D segment orientation, when calculating joint angles, you will select an XYZ rotation sequence. This will result in joint angles provide a rotation about the mediolateral, AP, and then axial axes. This is consistent with Vicon's joint angle calculations - and with the biomechanics convention. This means if you use the Visual3D segment orientation, when calculating joint angles, you will select an XYZ rotation sequence. This will result in joint angles provide a rotation about the mediolateral, AP, and then axial axes. This is consistent with Vicon's joint angle calculations - and with the biomechanics convention.
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 ==== Marker Set ==== ==== Marker Set ====
  
-To complete this tutorial, you should use the PiG marker<sup>[[#cite_note-PiGMarker-2|[2]]]</sup>. It will be easiest if you use the same naming convention. Please note, this is a minimal marker set, so if there is target drop out, or a target was not placed, most likely, you will not be able to use the data set. Please note this model is also very sensitive to the subject's posture during the static trial. When using this model, you should make sure that the subject is in a T-Pose during the static trial.+To complete this tutorial, you should use the PiG marker<sup>[[#cite_note-PiGMarker-2|[2]]]</sup>. It will be easiest if you use the same naming convention. Please note that this is a minimal marker set, so if there is target drop out, or a target was not placed, most likely, you will not be able to use the data set. Please note this model is also very sensitive to the subject's posture during the static trial. When using this model, you should make sure that the subject is in a T-Pose during the static trial.
  
 This image was adapted from the PiG Marker Set document <sup>[[#cite_note-PiGMarker-2|[2]]]</sup> This image was adapted from the PiG Marker Set document <sup>[[#cite_note-PiGMarker-2|[2]]]</sup>
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 {{:PiG_UE_MarkerSet.png}} {{:PiG_UE_MarkerSet.png}}
  
-==== Subject measurements ====+==== Subject Measurements ====
  
-In addition to subject **height & mass**, there are 4 required bilateral anthroprometric measurements that need to be measured on the subject.+In addition to subject **height & mass**, there are 4 required bilateral anthroprometric measurements that need to be measured on the subject:
  
-**Shoulder Offset:** This is the vertical distance from the center of the glenohumeral joint to the marker on the acromion calivicular joint (RSHO & LSHO). Some researchers have used the (anterior/posterior girth)/2 to establish a guideline for the parameter. +^ Measurement ^ Description ^ 
- +| Shoulder Offset | This is the vertical distance from the center of the glenohumeral joint to the marker on the acromion calivicular joint (RSHO & LSHO). Some researchers have used the (anterior/posterior girth)/2 to establish a guideline for the parameter. | 
-**Elbow Width:** This is the distance between the medial and lateral epicondyles of the humerus. +| Elbow Width | This is the distance between the medial and lateral epicondyles of the humerus. | 
- +| Wrist Width | This is the distance between the ulnar and radial styloids. | 
-**Wrist Width:** This is the distance between the ulnar and radial styloids. +| Hand Thickness | This is the distance between the dorsal and palmar surfaces of the hand. |
- +
-**Hand Thickness:** This is the distance between the dorsal and palmar surfaces of the hand.+
  
 ===== Create Segments ===== ===== Create Segments =====
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 ==== Sample Files ==== ==== Sample Files ====
  
-Sample files can be downloaded [[https://www.has-motion.com/download/examples/PiG_Examples/PiG_UE_Files.zip|here]]. +Sample files can be downloaded [[https://www.has-motion.com/download/examples/PiG_Examples/PiG_UE_Files.zip|here]]. The download contains two static trials:
- +
-The download will contain two static trials and two CMO files: +
   - Sub01_Static01.c3d can be used to follow this tutorial   - Sub01_Static01.c3d can be used to follow this tutorial
   - Sub01_Walk01.c3d is a dynamic trial which can be associated with this static trial   - Sub01_Walk01.c3d is a dynamic trial which can be associated with this static trial
-  - AltnerateDefinition.cmo is an example of the alternate definitions shown in the tutorial + 
-  - viconDefinition.cmo is an example of the Vicon definitions shown in the tutorial+The download also contains two [[visual3d:documentation:definitions:file_formats:cmo_format|CMO files]]:AltnerateDefinition.cmo is an example of the alternate definitions shown in the tutorial; and viconDefinition.cmo is an example of the Vicon definitions shown in the tutorial.
  
 ==== Model Metrics ==== ==== Model Metrics ====
  
-There are nine model metrics in this model which MUST be taken at the time of data collection. In some cases, Vicon requests the diameter, and in other cases, the radius is used. To "simplify" things, this tutorial will primarily the radius value. +There are nine model metrics in this model which MUST be taken at the time of data collection. In some cases, Vicon requests the diameter, and in other cases, the radius is used. To simplify things, this tutorial will primarily the radius value. Many of the landmarks/segment definitions are based on these metrics so it is VERY important to create these metrics.
- +
-Many of the landmarks/segment definitions are based on these metrics so it is VERY important to create these metrics.+
  
 Model Metrics Explained                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     Model Metrics Explained                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
 +  - **Height** (m): The subject's height in meters\
 +  - **Mass** (kg): The subject's weight in kilograms
 +  - **MarkerRadius** (m): The marker radius is half the diameter of the motion capture markers used for data collection
 +  - **L/RShoulderRadius** (m): The vertical offset from the base of the acromion marker to shoulder joint center<sup>[[#cite_note-PiGManual-1|[1]]]</sup> (pg. 18).
 +  - **L/RElbowRadius** (m): Half the width of the elbow along flexion axis (roughly between the distal epicondyles of the humerus)<sup>[[#cite_note-PiGManual-1|[1]]]</sup> (pg. 18).
 +  - **L/RWristRadius** (m): Half the mediolateral thickness of the wrist at the position where the wrist marker bar is attached<sup>[[#cite_note-PiGManual-1|[1]]]</sup> (pg. 18). NOTE: The Vicon documentation states the A/P thickness, but the WRA/WRB targets should be placed on the thumb/pinkie side of the wrist<sup>[[#cite_note-PiGMarker-2|[2]]]</sup> (pg. 2), which actually defines the mediolateral border of the wrist.
 +  - **L/RHandOffset** (m): The distance between the dorsum and palmar surfaces of the hand.
  
-  - **Height** (m): The subject's height in meters\\  +=== Create Model Metrics ===
-  - **Mass** (kg): The subject's weight in kilograms\\  +
-  - **MarkerRadius** (m): The marker radius is half the diameter of the motion capture markers used for data collection\\  +
-  - **L/RShoulderRadius** (m): The vertical offset from the base of the acromion marker to shoulder joint center<sup>[[#cite_note-PiGManual-1|[1]]]</sup> (pg. 18).\\ +
-  - **L/RElbowRadius** (m): Half the width of the elbow along flexion axis (roughly between the distal epicondyles of the humerus)<sup>[[#cite_note-PiGManual-1|[1]]]</sup> (pg. 18).\\  +
-  - **L/RWristRadius** (m): Half the mediolateral thickness of the wrist at the position where the wrist marker bar is attached<sup>[[#cite_note-PiGManual-1|[1]]]</sup> (pg. 18). NOTE: The Vicon documentation states the A/P thickness, but the WRA/WRB targets should be placed on the thumb/pinkie side of the wrist<sup>[[#cite_note-PiGMarker-2|[2]]]</sup> (pg. 2), which actually defines the mediolateral border of the wrist.\\  +
-  - **L/RHandOffset** (m): The distance between the dorsum and palmar surfaces of the hand| +
- +
-Create Model Metrics                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              +
  
 **1. Create Subject Metrics:**\\  **1. Create Subject Metrics:**\\ 
Line 125: Line 95:
  
 Prior to creating the head segment, 3 landmarks must be created: Prior to creating the head segment, 3 landmarks must be created:
- 
   - Head_Front - the midpoint between the LBHD and RBHD   - Head_Front - the midpoint between the LBHD and RBHD
   - Head_Back - the midpoint between the LBHD and RBHD   - Head_Back - the midpoint between the LBHD and RBHD
Line 134: Line 103:
 **NOTE:** The Head_Mid landmark is used as the distal end of the segment so that the segment geometry is created in the appropriate location. **NOTE:** The Head_Mid landmark is used as the distal end of the segment so that the segment geometry is created in the appropriate location.
  
-===Head Landmarks===     +=== Head Landmarks ===     
  
 {{ :PiG_UE_Head_Front.png}}                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 {{ :PiG_UE_Head_Front.png}}                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                
Line 141: Line 110:
   - Click **Landmarks** button   - Click **Landmarks** button
   - **Add New Landmark** button   - **Add New Landmark** button
-  - Create Landmark: Head_Front// // **Landmark Name:** //Head_Front//\\ **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //RFHD//\\    **Ending Point:** //LFHD//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **AXIAL:** //0.5// \\ **Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)// **Check:** //Calibration Only Landmark//  +  - Create Landmark: Head_Front \\ \\ **Landmark Name:** //Head_Front// \\ **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //RFHD//\\    **Ending Point:** //LFHD//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **AXIAL:** //0.5// \\ **Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)// \\ **Check:** //Calibration Only Landmark//  
  
 ---- ----
Line 150: Line 119:
   - Click **Landmarks** button   - Click **Landmarks** button
   - Click **Add New Landmark** button   - Click **Add New Landmark** button
-  - Create Landmark: Head_Back \\ \\ **Landmark Name:** //Head_Back//\\ **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //RBHD//\\    **Ending Point:** //LBHD//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **AXIAL:** //0.5//\\ **Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)//\\ **Check:** //Calibration Only Landmark//+  - Create Landmark: Head_Back \\ \\ **Landmark Name:** //Head_Back// \\ **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //RBHD//\\    **Ending Point:** //LBHD//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **AXIAL:** //0.5//\\ **Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)// \\ **Check:** //Calibration Only Landmark//
  
 ---- ----
Line 159: Line 128:
   - Click **Landmarks** button   - Click **Landmarks** button
   - Click **Add New Landmark** button   - Click **Add New Landmark** button
-  - Create Landmark: Head_Mid \\ \\ **Landmark Name:** //Head_Mid//\\ **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //Head_Front//\\    **Ending Point:** //Head_Back//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **AXIAL:** //0.5//\\**Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)//\\**Check:** //Calibration Only Landmark//+  - Create Landmark: Head_Mid \\ \\ **Landmark Name:** //Head_Mid//\\ **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //Head_Front//\\    **Ending Point:** //Head_Back//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **AXIAL:** //0.5// \\ **Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)// \\ **Check:** //Calibration Only Landmark//
  
 ---- ----
Line 165: Line 134:
 {{ :PiG_UE_Head_Right.png}} {{ :PiG_UE_Head_Right.png}}
  
-**4. Create Head_Right: +**4. Create Head_Right:** 
-  - **Click **Landmarks** button+  - Click **Landmarks** button
   - Click **Add New Landmark** button   - Click **Add New Landmark** button
   - Create Landmark: Head_Right\\ \\ **Landmark Name:** //Head_Right//\\ **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //RFHD//\\    **Ending Point:** //RBHD//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **AXIAL:** //0.5// \\ **Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)// \\ **Check:** //Calibration Only Landmark//   - Create Landmark: Head_Right\\ \\ **Landmark Name:** //Head_Right//\\ **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //RFHD//\\    **Ending Point:** //RBHD//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **AXIAL:** //0.5// \\ **Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)// \\ **Check:** //Calibration Only Landmark//
Line 179: Line 148:
   - In the **Segments** tab, select //Head// in the Segment Name box.   - In the **Segments** tab, select //Head// in the Segment Name box.
   - Click on the **Create Segment** button.   - Click on the **Create Segment** button.
-  - In the **Head** tab, enter these values:\\ \\ **Define Proximal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //Head_Front//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //0.5*DISTANCE(RFHD,LFHD)//\\ **Define Distal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //Head_Mid//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //0.5*DISTANCE(RBHD,LBHD)//\\ **Extra Target to Define Orientation**\\    **Location:** //Medial//     //Head_Right//\\ **Select Tracking Targets:**\\      //LBHD//, //LFHD//, //RBHD//, //RFHD//\\ \\+  - In the **Head** tab, enter these values:\\ \\ **Define Proximal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //Head_Front//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //0.5*DISTANCE(RFHD,LFHD)//\\ **Define Distal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //Head_Mid//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //0.5*DISTANCE(RBHD,LBHD)//\\ **Extra Target to Define Orientation**\\    **Location:** //Medial//     //Head_Right// \\ **Select Tracking Targets:** \\      //LBHD//, //LFHD//, //RBHD//, //RFHD//\\ \\
   - Click on **Build Model.**   - Click on **Build Model.**
   - Click on **Close Tab** before proceeding.   - Click on **Close Tab** before proceeding.
Line 188: Line 157:
  
 **2. Modify the [[Visual3D:Documentation:Modeling:Segments:Modify_Segment_Coordinate_System#Modify_Segment_Coordinate_System|Segment Coordinate System]]:** **2. Modify the [[Visual3D:Documentation:Modeling:Segments:Modify_Segment_Coordinate_System#Modify_Segment_Coordinate_System|Segment Coordinate System]]:**
-  - Define the Segment Orientation as:\\  **A/P Axis:** //+Z//\\    **Distal to Proximal:** //+Y//\\+  - Define the Segment Orientation as: \\ **A/P Axis:** //+Z// \\ **Distal to Proximal:** //+Y//
  
 ---- ----
Line 219: Line 188:
   - Click **Landmarks** button   - Click **Landmarks** button
   - Click **Add New Landmark** button   - Click **Add New Landmark** button
-  - Create Landmark: Thorax_Prox\\ \\ **Landmark Name:** //Thorax_Prox//\\ **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //CLAV//\\    **Ending Point:** //C7//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **AXIAL:** //0.5//**Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)//**Check:** //Calibration Only Landmark//+  - Create Landmark: Thorax_Prox\\ \\ **Landmark Name:** //Thorax_Prox//\\ **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //CLAV//\\    **Ending Point:** //C7//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **AXIAL:** //0.5// \\ **Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)// \\ **Check:** //Calibration Only Landmark//
  
 ---- ----
Line 237: Line 206:
   - Click **Landmarks** button   - Click **Landmarks** button
   - Click **Add New Landmark** button   - Click **Add New Landmark** button
-  - Create Landmark: Thorax_AP\\ \\ **Landmark Name:** //Thorax_AP//\\ **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //CLAV//\\    **Ending Point:** //STRN//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **AXIAL:** //0.5//\\**Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)//\\ **Check:** //Calibration Only Landmark//+  - Create Landmark: Thorax_AP\\ \\ **Landmark Name:** //Thorax_AP//\\ **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //CLAV//\\    **Ending Point:** //STRN//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **AXIAL:** //0.5// \\ **Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)//\\ **Check:** //Calibration Only Landmark//
  
 ---- ----
Line 258: Line 227:
   - Scale:\\    **Scale Height:** //120//\\    **Scale Width:** //120//\\    **Scale Depth:** //120//\\    - Scale:\\    **Scale Height:** //120//\\    **Scale Width:** //120//\\    **Scale Depth:** //120//\\ 
  
 +----
 ==== Clavicle ==== ==== Clavicle ====
  
Line 264: Line 234:
 However, if you still wish to create the Clavicle, instructions can be found [[Visual3D:Documentation:Modeling:Marker_Sets:Plug-In_Gait_Clavicle|here]]. If you are tracking using [[Visual3D:Documentation:Kinematics_and_Kinetics:Six_Degrees_of_Freedom#6_DOF_Tracking|6 DOF]] (the default), do NOT create the Clavicle, however if you are using [[Visual3D:Documentation:Kinematics_and_Kinetics:Inverse_Kinematics|Inverse Kinematics]], it is ok to create the Clavicle. However, if you still wish to create the Clavicle, instructions can be found [[Visual3D:Documentation:Modeling:Marker_Sets:Plug-In_Gait_Clavicle|here]]. If you are tracking using [[Visual3D:Documentation:Kinematics_and_Kinetics:Six_Degrees_of_Freedom#6_DOF_Tracking|6 DOF]] (the default), do NOT create the Clavicle, however if you are using [[Visual3D:Documentation:Kinematics_and_Kinetics:Inverse_Kinematics|Inverse Kinematics]], it is ok to create the Clavicle.
  
 +----
 ==== Upper Arm ==== ==== Upper Arm ====
  
Line 276: Line 247:
 These landmarks are required to create the Upper Arm segment, regardless if you use the Alternative Shoulder Definition (described above) or the [[Visual3D:Documentation:Modeling:Marker_Sets:Plug-In_Gait_Clavicle#Clavicle_Landmarks|Vicon Shoulder Definition]]. These landmarks are required to create the Upper Arm segment, regardless if you use the Alternative Shoulder Definition (described above) or the [[Visual3D:Documentation:Modeling:Marker_Sets:Plug-In_Gait_Clavicle#Clavicle_Landmarks|Vicon Shoulder Definition]].
  
-In the instructions below, the definition of the shoulder joint center (SJC) is different from Vicon's shoulder definition. In the definition below, the SJC is created below the SHO target in the -Z direction of the trunk coordinate system. I recommend using this SJC definition since it is more straight forward (more intuitive) and leaves less room for error. If you would like to use the **Vicon Definition** for the shoulder joint center, you should follow the instructions for the [[Visual3D:Documentation:Modeling:Marker_Sets:Plug-In_Gait_Clavicle#Clavicle_Landmarks|Clavicle Landmarks]]. Regardless of whether you use the SJC method below, or the Vicon definition, you can use either the Vicon or Alternative definition for the Upper Arm Segment. +In the instructions below, the definition of the shoulder joint center (SJC) is different from Vicon's shoulder definition. In the definition below, the SJC is created below the SHO target in the -Z direction of the trunk coordinate system. I recommend using this SJC definition since it is more straight forward (more intuitive) and leaves less room for error. If you would like to use the **Vicon Definition** for the shoulder joint center, you should follow the instructions for the [[Visual3D:Documentation:Modeling:Marker_Sets:Plug-In_Gait_Clavicle#Clavicle_Landmarks|Clavicle Landmarks]]. Regardless of whether you use the SJC method below, or the Vicon definition, you can use either the Vicon or Alternative definition for the Upper Arm Segment.                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
- +
-Upper Arm Landmarks                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                +
  
 {{ :PiG_UE_LSHJC2_v2.png}} {{ :PiG_UE_LSHJC2_v2.png}}
  
-**1. Create LSJC:**\\ +**1. Create LSJC:**
   - Click **Landmarks** button   - Click **Landmarks** button
   - Click **Add New Landmark** button   - Click **Add New Landmark** button
-  - Create Landmark: LSJ \\ \\ **Landmark Name:** //LSJC//\\ **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //LSHO//\\    **Existing Segment:** //Thorax/Ab//\\Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **ML:** //0.0//\\    **AP:** //0.0//\\    **AXIAL:** //- ( LShoulderRadius + MarkerRadius )//**Do NOT Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)//**Check:** //Calibration Only Landmark//+  - Create Landmark: LSJ \\ **Landmark Name:** //LSJC//\\ **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //LSHO//\\    **Existing Segment:** //Thorax/Ab// \\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **ML:** //0.0//\\    **AP:** //0.0//\\    **AXIAL:** //- ( LShoulderRadius + MarkerRadius )// \\ **Do NOT Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)// \\ **Check:** //Calibration Only Landmark//
  
  
-**2. Create RSJC:**\\ \\  +**2. Create RSJC:**
   - When defining the right landmark, use same definitions as for the left landmark    - When defining the right landmark, use same definitions as for the left landmark 
  
Line 296: Line 264:
 {{ :PiG_UE_LWJC.png}} {{ :PiG_UE_LWJC.png}}
  
-**3. Create LWJC:**\\ +**3. Create LWJC:**
   - Click **Landmarks** button    - Click **Landmarks** button 
   - Click **Add New Landmark** button   - Click **Add New Landmark** button
-  - Create Landmark: LWJC \\ \\**Landmark Name:** //LWJC//\\ **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //LWRA//\\    **Ending Point:** //LWRB//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **AXIAL:** //0.5// \\ **Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)// \\ **Do NOT Check:** //Calibration Only Landmark// \\+  - Create Landmark: LWJC \\ \\ **Landmark Name:** //LWJC//\\ **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //LWRA//\\    **Ending Point:** //LWRB//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **AXIAL:** //0.5// \\ **Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)// \\ **Do NOT Check:** //Calibration Only Landmark// \\
  
  
 **4. Create RWJC** **4. Create RWJC**
-\\ \\ When defining the right landmark, use same definitions as for the left landmark\\ +  - When defining the right landmark, use same definitions as for the left landmark
  
 ---- ----
Line 312: Line 280:
   - Click **Landmarks** button   - Click **Landmarks** button
   - Click **Add New Landmark** button   - Click **Add New Landmark** button
-  - Create Landmark: LEJC \\ \\ **Landmark Name:** //LEJC//\\ **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //LELB//\\    **Ending Point:** //LSJC//\\    **Lateral Object:** //LWJC//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **ML:** //- ( LElbowRadius + MarkerRadius )//\\    **AP:** //0.0//\\    **AXIAL:** //0.0// \\**Do NOT Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)//\\ **Check:** //Calibration Only Landmark// +  - Create Landmark: LEJC \\ **Landmark Name:** //LEJC//\\ **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //LELB//\\    **Ending Point:** //LSJC//\\    **Lateral Object:** //LWJC//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **ML:** //- ( LElbowRadius + MarkerRadius )//\\    **AP:** //0.0//\\    **AXIAL:** //0.0// \\ **Do NOT Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)//\\ **Check:** //Calibration Only Landmark// 
  
-**6. Create REJC:**\\ When defining the right landmark, use same definitions as for the left landmark+**6. Create REJC:** 
 +  - When defining the right landmark, use same definitions as for the left landmark
  
 ---- ----
Line 321: Line 290:
  
 The origin is defined at the SJC. The Axial axis is defined along the line from the SJC to EJC. The ML axis is along the line from the EJC to the ELB. The origin is defined at the SJC. The Axial axis is defined along the line from the SJC to EJC. The ML axis is along the line from the EJC to the ELB.
- 
-Upper Arm - Alternate Definition 
  
 {{ :PiG_UE_LUpperArm_Alt_Def.png}}                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       {{ :PiG_UE_LUpperArm_Alt_Def.png}}                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
Line 329: Line 296:
   - In the **Segments** tab, select //Left Upper Arm// in the Segment Name box.   - In the **Segments** tab, select //Left Upper Arm// in the Segment Name box.
   - Click on the **Create Segment** button.   - Click on the **Create Segment** button.
-  - In the **Left Upper Arm** tab, enter these values:\\ \\**Define Proximal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LSJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LShoulderRadius//\\ **Define Distal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LEJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LElbowRadius//\\  **Extra Target to Define Orientation**\\    **Location:** //Lateral//     //LELB//\\ \\ \\ **Select Tracking Targets:**\\      //LELB//, //LSHO//, //LUPA//\\+  - In the **Left Upper Arm** tab, enter these values:\\ \\ **Define Proximal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LSJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LShoulderRadius//\\ **Define Distal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LEJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LElbowRadius//\\  **Extra Target to Define Orientation**\\    **Location:** //Lateral//     //LELB// \\ **Select Tracking Targets:** \\      //LELB//, //LSHO//, //LUPA// \\ \\
   - Click on **Build Model.**   - Click on **Build Model.**
   - Click on **Close Tab** before proceeding   - Click on **Close Tab** before proceeding
Line 341: Line 308:
   - Click the **Copy & Reflect Selected Segment** button.   - Click the **Copy & Reflect Selected Segment** button.
   - In the **Right Upper Arm** tab, make sure the right side values are displayed (the radius values are often not updated correctly - so make sure to update these for the right side).     - In the **Right Upper Arm** tab, make sure the right side values are displayed (the radius values are often not updated correctly - so make sure to update these for the right side).  
 +
 +----
  
 === Upper Arm Vicon Definition === === Upper Arm Vicon Definition ===
Line 346: Line 315:
 The origin is defined at the SJC. The Axial axis is defined along the line from the SJC to EJC. The ML axis is perpendicular to the plane defined by the SJC, EJC, and WJC. The origin is defined at the SJC. The Axial axis is defined along the line from the SJC to EJC. The ML axis is perpendicular to the plane defined by the SJC, EJC, and WJC.
  
-**NOTE:** Since the SJC, EJC, and WJC landmarks are nearly colinear, creating the ML axis perpendicular to this plane can cause inconsistencies. For example, if you download the PiG_UE_Vicon.cmo file, you will notice the ML axis for the upper arm is pointing up. If you change the LElbowRadius to 0.05 (from 0.06), and hit Recalc, the ML axis will rotate 180 degrees. This seems to leave a lot to chance... You will also notice that the ML axis is not aligned with the ELB target. Typically, the flexion/extension axis is aligned with line between the elbow joint center and lateral epicondyle. For these reasons, I would recommend using the Alternative Definition for the Upper Arm. +**NOTE:** Since the SJC, EJC, and WJC landmarks are nearly colinear, creating the ML axis perpendicular to this plane can cause inconsistencies. For example, if you download the PiG_UE_Vicon.cmo file, you will notice the ML axis for the upper arm is pointing up. If you change the LElbowRadius to 0.05 (from 0.06), and hit Recalc, the ML axis will rotate 180 degrees. This seems to leave a lot to chance... You will also notice that the ML axis is not aligned with the ELB target. Typically, the flexion/extension axis is aligned with line between the elbow joint center and lateral epicondyle. For these reasons, I would recommend using the Alternative Definition for the Upper Arm.                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
- +
-Upper Arm - Vicon Definition                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                +
  
 {{ :PiG_UE_LUpperArm_Def.png}} {{ :PiG_UE_LUpperArm_Def.png}}
Line 355: Line 322:
   - In the **Segments** tab, select //Left Upper Arm// in the Segment Name box.   - In the **Segments** tab, select //Left Upper Arm// in the Segment Name box.
   - Click on the **Create Segment** button.   - Click on the **Create Segment** button.
-  - In the **Left Upper Arm** tab, enter these values:\\ \\   **Define Proximal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LSJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LShoulderRadius//\\    **Define Distal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LEJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LElbowRadius//\\    **Extra Target to Define Orientation**\\    **Location:** //Posterior//     //LWJC//\\ \\ \\   **Select Tracking Targets:**\\      //LELB//, //LSHO//, //LUPA//\\  +  - In the **Left Upper Arm** tab, enter these values:\\ \\  **Define Proximal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LSJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LShoulderRadius// \\  **Define Distal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LEJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LElbowRadius// \\  **Extra Target to Define Orientation**\\    **Location:** //Posterior//     //LWJC// \\  **Select Tracking Targets:**\\      //LELB//, //LSHO//, //LUPA// \\ \\ 
-  - Click on **Build Model.*+  - Click on **Build Model.**
   - Click on **Close Tab** before proceeding.   - Click on **Close Tab** before proceeding.
  
 ---- ----
-{{ :PiG_UE_RightUpperArm.png}}|+ 
 +{{ :PiG_UE_RightUpperArm.png}}
  
 **2. Create Right Upper Arm Segment:** **2. Create Right Upper Arm Segment:**
Line 367: Line 335:
   - In the **Right Upper Arm** tab, make sure the right side values are displayed (the radius values are often not updated correctly - so make sure to update these for the right side).   - In the **Right Upper Arm** tab, make sure the right side values are displayed (the radius values are often not updated correctly - so make sure to update these for the right side).
  
 +----
 ==== Forearm ==== ==== Forearm ====
  
Line 379: Line 348:
 Another difference between the Vicon definition and the alternate definition is that the ELB target is placed on the humerus, so it shouldn't really be used to track the forearm. For this reason, in the alternate definition, a landmark at the distal end of the upper arm is used to track the forearm. Another difference between the Vicon definition and the alternate definition is that the ELB target is placed on the humerus, so it shouldn't really be used to track the forearm. For this reason, in the alternate definition, a landmark at the distal end of the upper arm is used to track the forearm.
  
-Forearm Landmarks - Alternate Definition                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        +**Forearm Landmarks - Alternate Definition**                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
  
 {{ :PiG_UE_LEJC_Track.png}} {{ :PiG_UE_LEJC_Track.png}}
Line 386: Line 355:
   - Click **Landmarks** button   - Click **Landmarks** button
   - Click **Add New Landmark** button   - Click **Add New Landmark** button
-  - Create Landmark: LEJC_Track//\\ //\\ \\   **Landmark Name:** //LEJC_Track//\\ \\ \\    **Define Orientation Using:**\\    **Existing Segment:** //Left Upper Arm//\\ \\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **ML:** //0.0//\\    **AP:** //0.0//\\    **AXIAL:** //-1//**Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)//**Do NOT Check:** //Calibration Only Landmark//  +  - Create Landmark: LEJC_Track \\ \\   **Landmark Name:** //LEJC_Track// \\    **Define Orientation Using:**\\    **Existing Segment:** //Left Upper Arm// \\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **ML:** //0.0//\\    **AP:** //0.0//\\    **AXIAL:** //-1// \\ **Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)// \\ **Do NOT Check:** //Calibration Only Landmark// 
- +
-----+
  
 **2. Create REJC_Offset:** **2. Create REJC_Offset:**
   - When defining the right landmark, use same definitions as for the left landmark   - When defining the right landmark, use same definitions as for the left landmark
  
-Forearm - Alternate Definition+---- 
 + 
 +**Forearm - Alternate Definition**
  
 {{ :PiG_UE_LForearm_Alt_Def.png}} {{ :PiG_UE_LForearm_Alt_Def.png}}
Line 400: Line 369:
   - In the **Segments** tab, select //Left Forearm// in the Segment Name box.   - In the **Segments** tab, select //Left Forearm// in the Segment Name box.
   - Click on the **Create Segment** button.   - Click on the **Create Segment** button.
-  - In the **Left Forearm** tab, enter these values:\\ \\    **Define Proximal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LEJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LElbowRadius//\\   **Define Distal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LWJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LWristRadius//\\    **Extra Target to Define Orientation**\\    **Location:** //Medial//     //LWRB//\\    **Select Tracking Targets:**\\      //LEJC_Track//, //LFRA//, //LWRA//, //LWRB//\\ +  - In the **Left Forearm** tab, enter these values:\\ \\   **Define Proximal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LEJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LElbowRadius// \\   **Define Distal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LWJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LWristRadius//\\   **Extra Target to Define Orientation**\\    **Location:** //Medial//     //LWRB//\\   **Select Tracking Targets:**\\      //LEJC_Track//, //LFRA//, //LWRA//, //LWRB// \\ \\ 
   - Click on **Build Model.**   - Click on **Build Model.**
   - Click on **Close Tab** before proceeding.    - Click on **Close Tab** before proceeding. 
Line 414: Line 383:
   - In the **Right Forearm** tab, make sure the right side values are displayed (the radius values are often not updated correctly - so make sure to update these for the right side).   - In the **Right Forearm** tab, make sure the right side values are displayed (the radius values are often not updated correctly - so make sure to update these for the right side).
  
 +----
 === Vicon Forearm Definition === === Vicon Forearm Definition ===
  
Line 422: Line 392:
 **NOTE:** Since supination/pronation occurs by rotating the forearm, this definition is atypical and is specific to the Plug-in Gait Model. The Plug-in Gait model is created so that supination/pronation will be seen in the wrist joint angle instead of the elbow joint angle. **NOTE:** Since supination/pronation occurs by rotating the forearm, this definition is atypical and is specific to the Plug-in Gait Model. The Plug-in Gait model is created so that supination/pronation will be seen in the wrist joint angle instead of the elbow joint angle.
  
-Forearm Landmarks - Vicon Definition+=== Forearm Landmarks - Vicon Definition ===
  
 {{ :PiG_UE_LFA_Offset.png}} {{ :PiG_UE_LFA_Offset.png}}
Line 429: Line 399:
   - Click **Landmarks** button   - Click **Landmarks** button
   - Click **Add New Landmark** button   - Click **Add New Landmark** button
-  - Create Landmark: LFA_Offset//\\ //\\ \\ **Landmark Name:** //LFA_Offset//\\    **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //LEJC//\\    **Existing Segment:** //Left Upper Arm//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **ML:** //0.05//\\    **AP:** //0.0//\\    **AXIAL:** //0.0//**Do NOT Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)//**Check:** //Calibration Only Landmark// +  - Create Landmark: LFA_Offset//\\ //\\ \\ **Landmark Name:** //LFA_Offset//\\    **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //LEJC//\\    **Existing Segment:** //Left Upper Arm//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **ML:** //0.05//\\    **AP:** //0.0//\\    **AXIAL:** //0.0// \\ **Do NOT Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)// \\ **Check:** //Calibration Only Landmark// 
  
----- 
  
- **2. Create REJC_Offset:**\\ \\ - When defining the right landmark, use same definitions as for the left landmark, **EXCEPT :**\\ \\   * Specify the **ML:** offset as //-0.05//|+ **2. Create REJC_Offset:** 
 +  - When defining the right landmark, use same definitions as for the left landmark, **EXCEPT :** \\    Specify the **ML:** offset as //-0.05// 
 + 
 +----
  
-Forearm - Vicon Definition                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    +=== Forearm - Vicon Definition ===                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
  
 {{ :PiG_UE_LForearm_Def.png}} {{ :PiG_UE_LForearm_Def.png}}
Line 442: Line 414:
   - In the **Segments** tab, select //Left Forearm// in the Segment Name box.   - In the **Segments** tab, select //Left Forearm// in the Segment Name box.
   - Click on the **Create Segment** button.   - Click on the **Create Segment** button.
-  - In the **Left Forearm** tab, enter these values:\\ \\    **Define Proximal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LEJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LElbowRadius//\\    **Define Distal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LWJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LWristRadius//\\   **Extra Target to Define Orientation**\\    **Location:** //Medial//     //LFA_Offset//\\    **Select Tracking Targets:**\\      //LWJC//, //LELB//, //LFRA//\\ +  - In the **Left Forearm** tab, enter these values:\\ \\    **Define Proximal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LEJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LElbowRadius//\\    **Define Distal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LWJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LWristRadius//\\   **Extra Target to Define Orientation**\\    **Location:** //Medial//     //LFA_Offset//\\    **Select Tracking Targets:**\\      //LWJC//, //LELB//, //LFRA// \\ \\
   - Click on **Build Model.**   - Click on **Build Model.**
   - Click on **Close Tab** before proceeding.     - Click on **Close Tab** before proceeding.  
Line 456: Line 428:
   - In the **Right Forearm** tab, make sure the right side values are displayed (the radius values are often not updated correctly - so make sure to update these for the right side).    - In the **Right Forearm** tab, make sure the right side values are displayed (the radius values are often not updated correctly - so make sure to update these for the right side). 
  
 +----
 ==== Hand ==== ==== Hand ====
  
Line 469: Line 442:
   - Click **Landmarks** button   - Click **Landmarks** button
   - Click **Add New Landmark** button   - Click **Add New Landmark** button
-  - Create Landmark: LHJC//\\ //\\ \\   **Landmark Name:** //LHJC//\\    **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //LFIN//\\    **Ending Point:** //LWRA//\\    **Lateral Object:** //LWJC//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **ML:** //- ( LHandOffset + MarkerRadius )//\\    **AP:** //0.0//\\    **AXIAL:** //0.0//**Do NOT Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)//**Check:** //Calibration Only Landmark//+  - Create Landmark: LHJC \\ \\ **Landmark Name:** //LHJC//\\ **Define Orientation Using:**\\    **Starting Point:** //LFIN//\\    **Ending Point:** //LWRA//\\    **Lateral Object:** //LWJC//\\ Offset Using the Following **ML/AP/AXIAL** Offsets:\\    **ML:** //- ( LHandOffset + MarkerRadius )//\\    **AP:** //0.0//\\    **AXIAL:** //0.0// \\ **Do NOT Check:** //Offset by Percent (1.0 = 100%)// \\ **Check:** //Calibration Only Landmark// 
 + 
 +**2. Create RHJC:** 
 +  - When defining the right landmark, use same definitions as for the left landmark
  
 ---- ----
  
-**2. Create RHJC:**\\ \\ - When defining the right landmark, use same definitions as for the left landmark|+===Hand Definition===                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             
  
-===Hand Definition===                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             | +{{ :PiG_UE_Hand_Def.png}}
-||**1. Create Left Hand Segment:**\\ \\ <HTML><ol></HTML>\\ <HTML><li></HTML>In the **Segments** tab, select //Left Hand// in the Segment Name box.<HTML></li></HTML>\\ <HTML><li></HTML>Click on the **Create Segment** button.<HTML></li></HTML>\\ <HTML><li></HTML>In the **Left Hand** tab, enter these values:\\ \\ |<HTML><p></HTML>   **Define Proximal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LWJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LWristRadius//\\ <HTML></p></HTML>\\ \\ <HTML><p></HTML>   **Define Distal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LHJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LHandOffset//\\ <HTML></p></HTML>\\ \\ <HTML><p></HTML>   **Extra Target to Define Orientation**\\    **Location:** //Medial//     //LWRB//\\ <HTML></p></HTML>\\ \\ <HTML><p></HTML>   **Select Tracking Targets:**\\      //LFIN//, //LWRA//, //LWRB//\\ <HTML></p></HTML>||<HTML></li></HTML>\\ <HTML><li></HTML>Click on **Build Model.**<HTML></li></HTML>\\ <HTML><li></HTML>Click on **Close Tab** before proceeding.<HTML></li></HTML><HTML></ol></HTML>  |  {{:PiG_UE_Hand_Def.png}}|\\ \\ The image to the right (and all other images in this tutorial) show a mediolateral view of the segment coordinate system after it has been modified.\\ \\ |**2. Create Right Hand Segment:**\\ \\ - In the **Segments** tab, click the //Left Hand// in the created segment list.\\ - Click the **Copy & Reflect Selected Segment** button.\\ - In the **Right Hand** tab, make sure the right side values are displayed (the radius values are often not updated correctly - so make sure to update these for the right side).  |  {{:PiG_UE_RightHand.png}}||+
  
 +**1. Create Left Hand Segment:**
 +  - In the **Segments** tab, select //Left Hand// in the Segment Name box.
 +  - Click on the **Create Segment** button.
 +  - In the **Left Hand** tab, enter these values:\\ \\ **Define Proximal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LWJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LWristRadius// \\ **Define Distal Joint and Radius**\\    **Lateral:** //None//     **Joint:** //LHJC//     **Medial:** //None//     \\    **Radius:** //LHandOffset//\\ **Extra Target to Define Orientation**\\    **Location:** //Medial//     //LWRB// \\ **Select Tracking Targets:**\\      //LFIN//, //LWRA//, //LWRB// \\ \\ 
 +  - Click on **Build Model.**
 +  - Click on **Close Tab** before proceeding.
 +  - The image to the right (and all other images in this tutorial) show a mediolateral view of the segment coordinate system after it has been modified.
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 +{{ :PiG_UE_RightHand.png}}
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 +**2. Create Right Hand Segment:**
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 +  - In the **Segments** tab, click the //Left Hand// in the created segment list.
 +  - Click the **Copy & Reflect Selected Segment** button.
 +  - In the **Right Hand** tab, make sure the right side values are displayed (the radius values are often not updated correctly - so make sure to update these for the right side). 
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 ===== References ===== ===== References =====
  
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